Lavate molto bene le vongole e lasciatele a bagno con acqua e sale per almeno 2 ore.
Scolatele e mettetele in un tegame sul fuoco e lasciatele aprire e fare la loro acqua, sgusciatele, filtrate l'acqua di risulta e conservatela.
Pestate l'aglio e il basilico in un mortaio.
In una padella capiente scaldate l'olio con la cipolla tritata e appena prende colore unite il pesto di aglio e basilico, mescolate e unite la polpa dei pomodori finemente tritati e continuate la cottura.
Fate addensare la salsa e quindi allungatela con l'acqua delle vongole.
Lasciate consumare, regolate di sale se occorre e pepe; unite ora le vongole e lasciate ancora per qualche secondo sul fuoco (non di più altrimenti le vongole diventano gommose).
Lessate gli spaghetti in abbondante acqua salata, scolateli al dente e trasferiteli nella padella della salsa, saltate brevemente e servite.